現在PHPで解析結果閲覧画面を作ってます。
ページ閲覧中に、Rを再呼び出しして、再び解析を行い、ファイルを生成したものを画面表示したいのですが

<?php
system("R < rscript.R");
?>
としましてもうまく動いてくれません

ためしに書き出す先のパーミッションを777にしてみたり、パスをすべてフルパスに記述し直したりもしたのですが
うまく動きません

PHPの話題も織り交ざってますが、識者の方回答のほうよろしくおねがいします。