>正六角形の周上の二点を中心を通るような線分で結んだとき、
>対角線が一番長く、辺に垂直な奴が一番短いよね。

この説明で

>線分が正六角形の対角線となす角が小さいほど
>その線分の長さは長くなる

ここまで理解できました。
531のそこからずれるとの"そこ"というのは
正方形の一組の対辺が正六角形の一組の平行な二辺に対して平行になる時
ですよね?