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同型なグラフは二重に数えてよいんだよね?

頂点 v を含むのと含まないのとを別々に考えていけばいいんじゃない?
含むほうは、各部分木をどこでちょん切るかを数えればいいだけだし、
含まないほうはG-vに再帰的にアルゴリズムを適用するだけ。