gnuplot Ngraphインストールできました。
easypackageを利用することで何の苦労もなくインストールできます。
tgifのインストールもeasypackageを利用すれば難なくできます。

emathも導入いたしました。
しかし残念ながらTeXShop+ptex（桐木版）ではなかなか適切な情報にたどり着けず現在も模索中です。
現時点では、perlとの連携はでき、dviファイルをTeXShopで作るところまではできました。
しかしTeXShopでpdfまで作ることはまだできない状態です。

引き続きよい情報を探します。
プログラムの紹介をして下さったみなさんありがとうございました。