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人によってやり方違うけど。

SEMだと観察倍率より高倍で行うのが良いです。
フォーカスを合わせてから、像の流れを直すように
非点のダイヤルを合わせます。
像が流れていて、ピタッと来て、行き過ぎるのを確かめて下さい。
ピタッときたところで、フォーカスを合わせて、再度調整する。
フォーカスと非点(XとY)を交互にあわす、
これを繰り返すと、ちょうど良いところが出てきます。
元の倍率に戻すと、綺麗な像の出来上がり。
また、低倍過ぎると非点を認知できないので、補正するのが難しいです。

TEMは40万倍でアモルファスコントラスト(つぶつぶ)を見ます。
フォーカスをジャストで、粒が小さくor見えなくなるように非点(X、Y)を合わせます。
(大きくずれてると訳分からなくなるので、一度リセットするのが良いです。)
フォーカスをオーバー、アンダーに振って粒が流れてなければ出来上がり、
流れていたら修正してください。納得するまでじっくりやるのが良いと思います。
なお、Diffモードで、双眼鏡のぞいて
対物絞りがど真ん中に入るように気をつけてください。
低倍で写真撮るなら、非点をあわせなくても特に問題ないです。