>>563です。なんとか接続うまくいったので報告です。

＞HUBからきてるストレートケーブルを、AirMacBSのWANポートにつなぐのか、
＞LANポートにつなぐのかなど、
＞マニュアルを読んでみたのですが、判断がつきません。

これは結局WANポートに接続することでうまくいっています。
ベーステにISPからもらったクライアントIDを入力して、DHCP&NATをON、という設定です。
うまくいった時はベーステの設定を見ると、しっかりIPアドレスを取得してました。
だめな時は（イーサケーブルをベーステのLANポートに接続したりしてた時）、IPアドレスが192.42.249.13でした。

今はiBook側にも、10.0.1.2というIPアドレスがベーステから割り振られてうまくいってます。

結局３日もかかってしまいました。。
いろいろなことをためしたりしたので、最終的に何が決め手になったのか不明なところが痛いです。

アドバイスくださった方々ありがとうございました。