そんなもんインストーラーから抜き出して書き換える必要も無い
もしも本当に壊れているならTimeMacheの/S/L/E/AppleHDA.kextを/S/L/Eに持ってきてkextキャッシュクリアでもすれば直るだろ
パッチはCloverのConfig.plistの中で当ててるからCloverを破壊して無ければそのまま鳴る。そもそもCloverをバックアップして無いのか？