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H97ボードでビデオ周り怪しい書き込みしていたのは私です。上の自作パーツさらしていたやつ。
cloverのセットアップはどうしても途中でこけます。設定が甘いんでしょうけれど。

なのでEL Pwr Versionを使いました。
最初はネットが繋がらないので、AppleIntelE1000e.kextを入れて、
HD4600が使えるようにするAppleIntelHD5000Graphics.kextとAppleIntelFramebufferAzul.kextを
入れて、SSDをサムスンのに変えたら、ばっちりです。

解像度変更も画面のちらつきも消えました。

お騒がせしました。