El Capitan入れたら普段使ってる、ラジオ録音とか録画系のソフトのサウンド関連の不具合が出てきていろいろしてたら、ディスクユーティリティ使ったら不具合が全て直った。
ドライバーとかの対応の問題ではなかったみたい。