普通にOpenGLかまたはcocos2dみたいなゲームエンジン使ってるだろう。
パラパラ漫画だけじゃなくてヌルヌル動いてる部分はセルを細かく動かすとかすると、viewじゃ制御が大変すぎる。
アニメのキャンセルできないし。

エンジンつかってもヌルヌル部分の制御のプログラムは自分で作らないといけないけどね。用意されてるのはパラパラ漫画までだよ。