俺もiTunes StoreのUSアカウントとJPアカウントと2つのApple IDを使ってるんだが
USストアでしか落とせない無料アプリがあるから「消せばいい」と言われても困る…

ま、iPhoneのiTunesアプリでは普通にアップデートが表示されてるからいいかｗ