相談させて下さい。

Macbook Pro2011 lateのHDD（500GB）をSSDのPLEXTORのPX-128M5Sに交換しました。
SSDを組み替えてクリーンインストールを試みましたが、途中で止まってしまったので、
SSDを外付けの2.5インチケースに入れ、HDDを元に戻した後、クローンを作成してSSDを元に戻しました。

その結果、時間は非常にかかりますがOS Xは起動します。ですが
挙動ごとに時間がかかり作業にならない状況です。

起動ディスクの設定、PRAMクリアは行いましたが結果は変わりません。
あと2.5インチケースにSSDを入れた状態でSSDから起動すると速度は速いです。

何が原因かさっぱりわからないのです・・・。
この状況ではSSDを組み替えた状態で早く動かす事は出来ないのでしょうか？