MacBook Pro Late2006から新しくiMacに買いかえたら、
WiFi同期で一切iPhoneを認識しなくなりました。
ライトニングケーブルでつなぐと問題なく同期しますが…
「このiPhoneと同期する」にチェックは入ってます。

iMac Late2013 10.9
iTunes 11.1.2
iPhone 5s

同じ現象の方で直ったケースありますか?