単純に冷却の話なんだし別に良いじゃん。

見栄えをあまり気にしないなら底のふた開けて口径の大きなファンで冷やす(隙間はエアコンや換気扇のフィルターでふさぐ)、上に大きめのヒートシンクを載せるとか。
ついでに適当なスタンドで縦置きにしてやった上でメモリを上限まで増やしてやればほぼ内蔵のファンがフル回転することはなくなるよ。

あとはスポンジで内張りした箱に入れるのも手。
吸気排気の経路だけ気にしないといけないけど。