どうやら、indexPathが不明の場合のiCloud+CoreDataの更新処理は無理っぽいですね・・・。
これは手動並び替えにも言えることですが。
User→Event→Child
という構成になっています。1対多、1対多です。
MasterViewの複数のセルのEvent全部更新かけられればいいのですが、難しいですかね？
EventのセルタップしてChildへ行って、viewWillDisApearで受け渡したself.event,userにアプリのUser入れて、
ナビゲーションボタンで戻ると、MasterViewのEventは更新されます。

↓一応このサイトも参照しました。
http://stackoverflow.com/questions/16518301/refresh-uitableview-with-icloud-changes

このままの仕様でいきますかね・・・
なにかアドバイスいただけると幸いです。