Lightroomはうちの環境じゃとにかく重くてかったるかった。
現像後の自由度はApertureのほうがよかったし、インターフェイスは肌に合う感じだったし。
現像結果も素直な感じで好みだったし。
あと、写真の整理もApertureのほうがやりやすかった。

どっちを選ぶかはあくまで個人的な「好み」の問題だとは思うし、Lightroom2になってからは知らんけどね。