すみません、上記の質問の件は一応解決しました。

転送の可否はファイルの種類(?)に依るようで、
以前転送に成功したaviファイルやMacからCDで持っていったファイルだと
FTPで転送できました。
そこで不思議に思ってiTunes for Winを入れてそれでエンコしたら、
そのファイルは転送できました。

ただ…、
今日転送しようとしてできなかったのはWindows Madia Playerでエンコードした
mp3ファイルで、他にもWinのメモ帳で作ったファイル等も転送できませんでした。
Win→Macの場合は拡張子等、特に気にすることはないと思っていたのですが…。
これって何故なのでしょうか？後学のために教えていただけるとありがたいです。