原因が判った。

Cmd を Meta キーに割当てて pekwm でも同じく Meta+Tab でプログラムの切り替え出来
るように設定してたんだけど、スリープしちゃうと何故か X11 が aqua の Cmd+Tab を奪っ
ちゃうみたい。

option に super を割当てて、プログラムの切り替え方を変えると250の不具合は出なく
なった。