東大からの入札仕様書を見た訳じゃないのだが、
恐らく仕様はMacOSX Serverを使わないと仕様条件に合わないシステム構成だったんだろ
その仕様策定は東大側が事前に各社から提出された各種の見積、提案書等も考慮に入れ、
各社システムやOSを検討した結果、OSXでのシステム構成が
価格面、性能面等トータルに考えてベストだと判断してOSXに限定されるように仕様書に織り込んだと言う事だ。

で、OSXをサポートするハードを供給してるのはアップルしかないから結果として自動的にアップル製品が納入される事になる
もしAIXだったらIBM製品に限定されるのと何の違いは無い。
これがWinやLinux仕様だと、各社は自社製品のハードを提案している。
(勿論ハード的な性能は仕様書の条件を満たしているのが前提だが)
入札参加各社が同じMacでのシステム構成の中で、最終的にNECソリューションズが一番安く応札して落札されただけの話だ。