レスありがとうございます。

>>600
外してました。チェック入れてもう一度試してみます。
情報ありがとうです。（過去ログを良く読んでから質問するべきでした。）

>>601
ATOKをインストールする前とした後を比べ
明らかにアプリケーションの強制終了する回数が増えたので
原因はATOKではないかと疑っています。

>>602
いいえ。10.3はクリーンインストールです。
もっと細かく書けば10.2をUPGした10.3をCCCで別HDに丸ごとコピーし
元のHDに10.3をクリーンインストールした後、
別HDへコピーしたOSから必要なファイル（Keychains、preferences.plist等）を
元のHDへクリーンインストールした10.3へコピーしました。
3ヶ月ほどこの状態で使っていましたが
ATOKを入れるまで全く問題がなかったです。