>>277
Sound Studioはどう?
ttp://www.felttip.com/products/soundstudio/

各マーカーは自由に名前を変えられるし、「Split by Markers...」メニューで
分割保存できる(保存時の各ファイル名は「マーカー名」「連番+マーカー名」の
どちらも可能)。

ちょっと値は張るけど、機能は豊富だし値段分の価値はあると思う。
もっとも、単に分割保存するだけなら、もっと安い(もしくはフリーの)
ソフトがあるかもしれないけど。