Mac OS10.3でEudora6Jのシリアルを再入力したくて困ってるんだけど、
再インスコしても同じ情報を引き継いでるみたいで、変更できません。

ユーザー／ライブラリー／プリファレンスにある
Eudora 6.0J-Jr3 OSX.plist

以外に保管されてる場所ってありますか?

もち正規ユーザーです。