最初のうちはスパム箱をチェックしないと悲惨な目にあうけど
「スパムじゃないメール」を「command+option+J」でスパム認識させないようにして
判定リストを育てていけば、認識率は結構高くなってくるよ。
こういう仕様は他のメーラーでもだいたい同じ。
しきい値の設定はある程度認識率をあげたあとの微調整に使うとよろし。

http://www.zdnet.co.jp/products/0310/27/rj00_eudora.html