>>105
結合はmpgtxでできるかも。AC3だから音声を映像から分離してmp2化させ、
再統合して結合しなきゃならんかもしれないけど、うまくいけばCapty MPEG
Editとかで編集できるようになるかも。ツールとしては、mpgtx、a52decX、
Extractor、mp2encあたりを使う。正直チャプターが多い物はRDでレート変換
ダビングしといて取り込む方がずっと楽だと思うけど。

つかこの辺はDVDリッピング系のスレに逝ったほうがいいかも。