マルチバイトのID3タグがついてるファイルを
扱わなければほぼ問題ないと思うけど…。

iTunesのタグが腐ってるんだとおもうよ。
パディング領域とかはv2.3のタグがついてるファイルを
iTunesで編集した際に発生しやすいと思う。
書き換える際はあらかじめタグを消去して、一から
付け直したほうがいいと思う。

ファイル名を一括変換した際におかしなファイル名になるときは
v.1.1のタグを消去してから再チャレンジするといいよ。