862さん、863さん、865さん、866さんご意見ありがとうございます。
試しにNisusとは違うアプローチのテストアプリケーションを作ってみました。
よろしければご意見をお聞かせください。

大学のサイトがダウンしているので下記サイトに置いてあります。
ttp://www8.ocn.ne.jp/〜sonoisa/OgreKit/StyledReplaceTest.zip
(直リンク、164KB)

置換文字列に指定されたスタイルに従って置換を行うようになっています。
Nisusよりも少し複雑な置換を行えますし、置換履歴やFavoritesで管理しやすいのがこのアプローチの長所です。
一方、(ちょっと調べた感じでは)イタリックやボールドは別フォント扱いのため、
検索結果のフォントは変えずにスタイルだけをイタリックすることはできないという短所があります。
暇をみて解決できないかどうか調査してみます。