ひょっとしたら過去スレで話題になってたかもしれませんが、
Carbon Emacsで何かの拍子に日本語入力 (私は AquaSKK を使用) が
オンになってしまっていることがあります。
Emacs使用時には常に英語モードにしておくための方法って
ありましたっけ。