今夜思いついた単純な方法です．
主に，同一作曲家 同一ジャンルの数曲 同一演奏家 複数のCD の場合です．

＊CDをiTunesの 'アルバム' としないで，楽曲名を 'アルバム' 名とする です．

＊例 モーツァルトの6曲の弦楽五重奏曲　スーク/スメタナ四重奏団
　　 ディスク1に3番と4番，2に2番と6番，3に1番と5番　　なので，
　　 ディスク2ならトラック1-4の 'アルバム' 欄に Quintet No.2
トラック5-6の 'アルバム' 欄に Quintet No.６ と書き(ディスク1,3も同様に)，
ディスク3枚 'アーティスト' 欄は共通に Suk/Smetana Quartet　と書きます．

特にiPod上で楽曲が見やすくなると思います．