＞データ用、予備用に入れたデータ容量が基本システム用の中に加算されていきました。
＞ と、考えるとこのPCの全体HD容量が700Mしかないことになります。
の意味が分からないから答えようが無いなぁ...

システムが２つ入る容量があった方がいいのは、システムを再インストールする時に
前のシステムを保存してインスト出来る様にだから。
700MBあれば、使用システムとクリーン状態のシステムの２つ入るだろうから
まあ足りない事もないだろうけど、きりがいい１Gで切ったらいいんじゃ？

ソフトによっては、システムのあるHDにインストした方がいいものや、
システムの書類フォルダにデータをいれた方が良い物、便利な物があるので、
システム用のHDのパテはある程度余裕がある方がいいと思うよ。