システムのライブラリにはPreferencePanesしかなかったもので。
原因わかりました。
Homeに本マーク付きのlibraryとなしのライブラリと２つあり、
後者のフォルダのPreferenceを読み込んでいたようです。
両者共通する項目があってライブラリの方がメインみたいになってます。
いつの間に分岐したんだろう。。それともこれが正常ですか？