あのATOKに切り替えて再起動したら、そのままで起動しませんのか？

297以降のやりとりをみれば分かりますが、
システム環境設定→言語環境→入力メニューでことえりのチェックをはずす
それでもダメなら、ルートでログインして同じことをする。

ことえりとの共存方法は、他の方におまかせしまする。