これまた大掛かりなアップデーターで、app本体が入れ替わる。
FileMaker自体アップデートによる互換および不具合発生を心配しているようで
なんと、appディレクトリー下に.oldディレクトリーを作って
v1がそのまま収まっている....。

変更点はアップデーターを落としてからお読みくださいを参照という
手順になっているから、落とすだけ落としてから判断してみては。

ttp://www.filemaker.com/support/updaters.html