ソフトウェアアップデートをかけて再起動したら起動できなかったので、
本体の再起動スイッチで再起動して
シングルユーザモードでfsckにて検証したところ、

**Checking Catalog fileに「Missing thread record」
(id=964971)
**Catalog hierarchyに「Invalid Volume file count」
(if should be 233892 instead of 233893)
**Catalog Volume infomationに「Invalid Volume file count」
(if should be 233893 instead of 233892)

と3つのエラーが出ました。
**Catalog hierarchyと**Catalog Volume infomationの()内の数字は
fsckをするたびに減っているようです。

これは、ハードディスクをフォーマットしなければいけないのでしょうか?
現状で一応起動はしています。
10.2.4です。