>普段使用しているMacG4 DA 466Mhz と比べて処理する時間が(同じファイルで)
明らかに遅すぎるって感じです。

DA 466MHzのClassic環境と比べて遅いの?
それとも、DA 466MHzは、OS9?

OS9とClassic環境なら、当然OS9の方が速いと思うよ。800と、466くらいの差なら。