ATAカード経由の場合CPUの負担はほとんど変わりませんよ

内部バスでスレーブだと使用しているとCPUの要求に対してHDDの
（というより、ATAバスのかな？）転送速度が追付かないくて
フリーズするかも。
よって、スレーブはやめマスターのみにする。
それでだめならATAカード経由にする。
それでだめなら...あきらめてマシンを買替える