QSしか知らないので参考にならないかもしれないけど、
12cmファン用の2pコネクタはDOS/VのHDDアクセスランプのコネクタが挿せるよ。

で、ケースファン買うと大概4pの電源コネクタからファン用3pコネクタに
変換するハーネスが付属しているだろうから、コイツの3pコネクタを頂いてきて、
先ほどのアクセスランプ用2pコネクタと合体させると、変換ケーブルの完成。

ハンダ付けして繋ぐのが一番いいと思うけど、カーオーディオ用の圧着コネクタで
繋いでもいいかも。
カー用品店かホームセンター行けば、特殊工具とかいらなくてペンチでギュッと
挟むだけの奴があるよ。赤いプラスチック製のこんな奴↓
ttp://www.d1.dion.ne.jp/~miyawak/brake3.jpg

信頼性を保証することはできないけど、ファン交換すること自体既に保証外な
行為なんで、その辺は自己責任でよろすこ。