青>>赤>>緑の順に目に悪い順となります。
ただし、原色に近い濃い色の場合が目に悪影響を与えます。
その点で言うとWinXPのダイアログはかなり悪影響を与えます。
あと、ダイアログなどの目の前に突然表示されたときの人間に与えるストレスもあります。