URLをコメントに記入するのはOSの仕様じゃなくてアプリの仕様。
嫌ならURL書き込まないアプリ使えばいいし、設定で選べる奴もあったはず。
知らないうちも糞もリスト表示で見えるわけだし見えるから便利なんだし
消そうと思えば糞簡単。

それと、コメントが書かれてるのってデスクトップファイルなんじゃないかな。
個々のファイルのリソースじゃないような気がするす。

Winにコメント欄に相当するものがあるかどうかわからないが、
作ろうと思えば似たようなもん作れるだしょ？