>>718
> カーネルやら/usrやら/etcやらは/直下にばらまいたままにしないで、
> ひとつのディレクトリにまとめてパッケージにしてしまえばいいと

それはmac的にはそれでいいんだけど、unixという制限があるから出来ないのよ。
unixにもある程度伝統的なディレクトリ構成みたいなのがあって
unixのツール群(もちろんOSXが動くのに必須な物も多い)はそれを前提に動いてたりするから。
OSXはDarwinの上に作られてるから、darwinであるために必要な部分は変えられない。

だから、こいつからが隠れてるのはいいと思う。
>>719がいうようにあんまりいじって欲しくない部分を守れるからね。
でもどうしても必要なときにはfinderから見えて欲しいなと。