812さんの言う通り、Contributeはサーバーにアップ済みのページを
修正するためのツール。
比べるなら GoLive か Dreamweaver だよね。
学生、教職員ならDWでもそこそこの値段で手に入るよ。

でも論文をHTMLで作っても見づらいだけだと思う。
字だけがびっしり書いてあるだけの論文(?)なら別だけど、Draw系の図や
グラフなんかが画面の解像度じゃぜんぜん足らないから。
HTMLに書くのはアブストラクト程度にしといて、
論文自体はTexでもInDesigneでも使って、PDFで書き出すのが
いいと思うなあ。