……続き
#ここから
$path="/Users/ユーザー名/Library/Safari/";
$f1="Bookmarks.plist";
$f2="Bookmarks.dec.plist";
open(IN,"<$path$f1");
open(OUT,">$path$f2");
while ($cnt=<IN>){
$cnt =~ s/%([0-9a-fA-F][0-9a-fA-F])/chr(hex($1))/ego;
print OUT $cnt;
}
close(OUT); close(IN);
#ここまで

以上をie2safari2.plなどとファイルに保存。
terminalで「perl {パス}ie2safari2.pl」と実行。Bookmarks.dec.plistが出来るので
Bookmarks.plistにリネーム。これをmiで開き（SJISで化けてない筈）UTF-8にして保存。

（いずれのperlもユーザー名のとこ自分のを入れてねん）
うちはこれでうまく行きました。