結局MPEG4IPのmakeはできず。
そのかわりに、バイナリを発見しました。ちょっと面倒なので
簡単に書きます。
1)まずMediaPipeというソフトをダウンロード
2)Disk imageの中に[AAC.XVID] to MP4というソフトが
  入っているが、これは実はmp4creatorのラッパー。
  ターミナルなどでどんどん中を見ると、Resourcesの中に
  mp4creatorが入っている。これをパスが通っているところに
  コピーしてやると使えるようになる。コマンドは、下の3行を
  順番に打つのみ。

mp4creator -create=hoge.mp3 hoge.amc
mp4creator -delete=2 hoge.amc
mp4creator -delete=3 hoge.amc

すれ違いなのに長文すみませぬ。もし適切なスレがあったら誘導
お願いします。