すいません。最初の質問の仕方がまずかったみたいです。
今出来ている事
VOB->mpeg2decX->音声無しMOV(A)、VOB->a52decX->音声ファイル(B)
(A)と(B)をQuickTimeProで合体->音声有りMOV
やりたい事
VOB->「なんとかソフトで」->音声有りMOV
今のところ
83さんの言われるように、ffmpegを使うソフトで行えば出来るのかな？と思いました。
ffmpegのセットアップが大変そうですが、地道にやってみまたいと思います。
皆さん。ありがとうございました。