mencoderで字幕が黒くなる問題だけどたぶんこれで大丈夫じゃないかな。
その症状がどんなのかわかってないから間違ってるかも。

ffmpegXでEnocode押してTerminalがアクティブになったらcontrol+cで終了させる。
Terminalのウィンドウは閉じずにそのままにしておく。
テキストエディタを立ち上げてペーストすると文字列が。
文字列の中に -o <Save Asで指定したパス> ってあると思うから-oの前にでも -ifo を付け加える。
それからすぺてを選択してコピー。
さっきのTerminalのウィンドウをアクティブにして上矢印キーを押すと
% pbpaste | shって出てくると思うから出てきたらリターン。

DVDから直接の場合はたぶん必要ない。
-ifoオプションは本当はDVDの.ifoファイルを指定するんだけどたぶん何も指定しなくていい。
ここでは-ifoオプションを使ったかどうかが問題になるんだと思う。