IEの初期設定ファイルは、なんと初期設定フォルダの中じゃなくて、システムフォルダ直下の「MS Preferences」フォルダの中に
それっぽいファイルがある。
独自フォルダなんぞ作りやがって何様じゃこら。て感じ。
ただしこれ、Office入れると置き換えられたりするので、OEとかEntourageとかが使ってるんじゃないかなぁ？

ほかに、初期設定フォルダの中に「Explorer」フォルダがあって、この中に
「お気に入り」とか「履歴」とか「キャッシュ」とか「ツールバーの設定」が入ってる。
一時的に表示中の動画が保存してあったりもする。
「Download Cache」が巨大化していたら捨ててみるといいかもしれない。
それから、お気に入りの項目が増えすぎると重くなるよ。ブックマークユーティリティーに切り替えよう。
新しいFlash Playerなどはメモリ食いだし、IEにはたくさんメモリを割り当ててあげようね。
また、IEはしょっちゅうキャッシュにアクセスしているわけだから、
システムフォルダがあるHDDは容量に余裕を持たせ、デフラグもきちんとしよう。
DL用のパーティションとも分けた方がいいのかも。

Macの世界ではよく初期設定ファイルを捨てると調子がよくなるという話があるけど、
アップルメニュー以外でそれを体験した事がないのでよくわからん。
ひょっとしたらInternet Preferenceを捨てたら調子よくなるかもしれないしな。