IEのパス入力はモーダルダイアログ(タイトルバーの無い奴)だと思うが、
バックグラウンドのアプリがモーダルダイアログを開く必要が出てきた時
アプリケーションメニューがアイコンで点滅でお知らせしてくれる状態になる。
>>643の場合はIEがダイアログを出すのを先ず待たなきゃおかしい。

って事は>>643のような状態は本来おかしいわけで
おかしいのがシステムなのかIEなのか判断出来ないけど
怪しいと思われる物を再インスコが妥当な処置かと思う。