吸いません、このスレ以外の過去ログが見れないので質問なんですが、
過去に似たような（ffmpegXでavi出力が出来ず０バイトファイルが出来る）
症状で書かれてた方がいましたが、私は下記のようなログが出てます。

Input #0, mpeg, from '/Users/tatsu/Desktop/VIDEO_TS/VTS_01_1.VOB':
Stream #0.0: Video: mpegvideo, 720x480, 29.97 fps, 8000 kb/s
Number of stream maps must match number of output streams
Encoding complete!

ストリームマップの数を出力と同じにしろ！ってな訳だと思いますが、
MacDivXCreatorでもターミナルに同じログが出て書き出し出来ません。
どちらさんかヒントを〜