>>1さんどうもありがとうございます。その後いろいろやってみまして、

mpeg2decX、ffmpegX、MacDivXCreatorと使ってみたのですが、
どのソフトもほぼ同じ症状でした。（mpeg2decXはmovファイルに変換しようとしたのですが、
ターミナルは起動しませんでしたが、やはりできあがったファイルは0Kbでした・・）

一度も成功したことないので、わからないのですが、これらのソフトはエンコ中に
ステータス表示がでるのですか？とりあえず、うちのはこれらのソフトで
ステータス表示はされません（ターミナル起動がします）

再インストールもやったんですが、だめでした(´・ω・`)

>>ターミナル系、ffmpeg系の初期設定ファイル捨てて

・・・初期設定ファイル・・・？これは・・・どこに存在するんでしょうか（すいません）

なんかもうどのソフトでも症状は同じなので、たぶん原因は皆一緒なんだとは思いますが
、、、悔しいです(;TД⊂)