HDDも大容量化してきたので、そろそろMP3圧縮でなく保存しとこうかと思うんですが、
利便性とかもろもろ含めて、AIFFとWAVのどちらがいいでしょうか？

ポータブルプレイヤーで聴く時は、そのつどそこからエンコードするか、
MP3とAIFForWAV両方の形式で置いておくつもりですけど。