>>673
おっしゃるとおりですな。失礼。
思いきって user/Library/Preferences/com.apple.dock.plist をゴミ箱へポイして再設定ししました。
自分の環境だとドックは画面右側に配置しているんだけど、その状態でClearDockのTriangle Colorを再設定すると上手くカラーが反映されず黒に戻っちゃうことを確認しました。

ただし、ClearDock自体の問題なのか、他の影響なのかまでは検証してません。（OS Xになってから、その辺検証するのが自分のようなアプリケーションユーザには難しくなった気がする）

以上。